TMT/iTRAQ技术本质同为多肽的体外标记技术，利用2-11种同位素标签特异性标记多肽的氨基集团，然后进行串联质朴分析，可用于比较多组样品中蛋白质的相对含量。

TMT 标签分子骨架由三部分组成，报告基团，平衡基团和肽反应基团。不同的标签报告基团质量数不同，如Table 1所示的6中TMT标签，它们的报告基团质量数分别为126，127到131，相对应的它们的平衡基团质量数分别为104，103，这使得标签的总质量全部一致。

报告基团在多肽碎裂过程中发生碎裂形成独立的报告基团信号，这就使得：

在一级质谱图中，任何一种iTRAQ/TMT试剂标记不同样本中的同一多肽表现为相同的质荷比；

在二级质谱图中，报告离子表现为不同质荷比的峰，因此根据波峰的高度及面积，可以鉴定出蛋白质和分析出同一蛋白质不同处理的定量信息。