在数据非依赖性采集（DIA）模式下，将整个质谱扫描质量范围分为若干个窗口，在一个扫描循环内依次对每个窗口的所有母离子进行碎裂，并采集记录全部的子离子信息。DIA技术不需要指定目标肽段，扫描点数均匀，利用谱图库可以实现定性确认和定量离子筛选，同时可以实现数据回溯。

DIA vs DDA：

无歧视地获得所有肽段的信息，不会造成低丰度蛋白信息的丢失；

循环时间固定，扫描点数均匀，定量准确度高；

肽段的选择没有随机性，数据可以回溯，对于复杂蛋白样本，特别是低丰度蛋白具有更优异的重现性

DIA vs SRM：

无需提前指定目标 肽段，适用于未知蛋白分析；

无需优化方法，获得数据后再基于谱图库实现定性确证和定量离子筛选；

通量无上限，适合大 规模蛋白定量分析

DDA与DIA模式下，质谱数据采集过程对比：

A. 在MS1扫描过后，DDA围绕选中离子的质量范围选择一个极窄的质量窗口，对该窗口内的离子进行MS/MS扫描；

B. 在DIA中，500-900的质量范围被均匀细分成20个小窗口，MS/MS扫描没有限制在某个多肽，而是在扫描循环内依次对每个窗口的所有母离子进行碎裂，并采集记录全部的子离子信息；

C. DDA所得的二级图谱，所选母离子的碎裂信息在一张二级图谱中完全展示；

D. DIA每张二级图谱记录着多个多肽的子离子信息（例如这里的N, M, O, P），且单个多肽的信息分布在不同二级谱图中，但是这些信息可以分别被提取出来，且具有极佳的重现性